Per gestire gli ingressi audio in Mainstage devi creare delle Channel Strip Audio, non Instrument (uno per ingresso, quindi nel tuo caso 2, 1 Voce + 1 Tromba cui assocerai i relativi canali di Inout della Focusrite)
Usa uno dei Concert di esempio di Mainstage della sezione Vocal come esempio/base di partenza oppure leggi a pag. 54 della User Guide