Strano che le uscite mono te le faccia selezionare solo in fase di creazione, onestamente io ho sempre lavorato in stereo, tranne un caso in cui ho usato una uscita mono ma per creare una mandata Monitor generale (a livello concert), per cui purtroppo ci sta che sia una limitazione (forse poco logica ma mi resta il dubbio nel caso di AU stereo..) di Mainstage.
Per inviare ProgramChange ad un dispositivo MIDI esterno devi fare come hai detto, ovvero usare una Channel Strip External che come MIDI Out punti a quello della tua Focusrite ed invii i dati sul canale giusto.
Sul Px5s al momento non mi ricordo dove si settava il canale Global, ma dai un'occhiata al manuale (quello completo "Tutorial") nella sezione del menu MIDI e secondo me trovi tutte le info.
Edited 16 Nov. 2016 18:21